抗生素耐药性(AMR)正迅速成为全球公共卫生的“隐形大流行”。据估计,仅在2019年,全球就有超过500万人因 AMR 相关感染死亡,死亡规模已与新冠疫情相当。面对这一迫在眉睫的威胁,欧盟启动了由九国联合参与的ENDAMR(Exploring Novel Drivers of Antimicrobial Resistance)国际博士网络项目,旨在从根本上探索 AMR 的新驱动因素,并开发创新性解决方案,打破当前抗菌药物研发陷入的瓶颈。
🔗:https://endamr.eu/
01、项目背景
该项目不仅聚焦于细菌耐药性进化的分子机制、肠道微生物组的作用、水平基因转移与环境因素的交互,更延伸至诊断工具的开发与治疗策略的优化。通过多学科协作与跨国联合培养,ENDAMR 将为博士生提供月薪高达3400欧元的优厚支持,并赋予其科研能力之外的可转移技能,助力其在学术、产业或公共领域为全球抗击 AMR 危机贡献力量。
由欧洲九国联合开展,旨在培养应对 AMR 危机的科研新力量。项目将从四个核心方向入手:
- WP1:研究 AMR 如何影响肠道微生物组,寻找易感特征并开发基于微生物组的干预措施;
- WP2:探索 AMR 通过水平基因转移的获得机制,研究环境和宿主因素;
- WP3:解析耐药性的频率与机制,开发新型诊断工具与预测模型;
- WP4:基于机制互作,优化抗生素组合策略,提高治疗效果并可能逆转耐药性。
02、博士课题
1.识别人类肠道中抗药性机会致病菌的致命弱点
该项目研究了不同的肠道微生物组如何影响抗生素耐药性尿路细菌 (UPEC)。使用竞争性适应性测试,博士生将确定哪些细菌群落和营养物质会降低耐药 UPEC 菌株的适应性。该项目旨在了解这些健身成本背后的分子机制,并展示特定细老师株或分子如何防止不同微生物组环境(包括小鼠模型)中的耐药性 UPEC 定值。
2.微生物组内抗性突变的适应度效应
该项目研究抗生素耐药性如何影响肠道中的大肠杆菌适应性。博士生将研究不同微生物环境中耐药细菌和非耐药细菌之间的竞争,分析细菌如何随着时间的推移适应耐药成本,并研究细菌通讯(群体发送信号)在这些过程中的作用。该项目旨在提高对耐药性动力学的理解并为微生物组管理策略提供信息。
3.微生物组物种中的诱导抗性元件构成 AMR 的低适应成本储存库
该项目研究肠道细菌如何激活耐药蛋白以响应药物。博士生将确定哪些细菌蛋白在药物暴露后变得更加活跃,研究药物相互作用和拮抗作用,并评估这些耐药机制在细菌物种中的常见程度。该项目旨在绘制耐药性关系,并可以改进在靶向病原体的同时保护有益肠道细菌的治疗方法。
4.分析 HGT 和细老师株来追踪抗菌素耐药性的演变和传播
该项目研究抗生素耐药基因如何通过垂直(亲本到后代)和水平(菌株之间)转移在细菌种群中传播。博士生将跟踪物种和环境之间的基因运动,识别抗性储存库,并分析协同进化模式。通过绘制转移时间表和传播模式,该项目旨在使用进化生物学和计算分析为对抗抗生素耐药性的策略提供信息。
5.揭示偶联介导的抗生素耐药基因在肠杆菌科中传播的驱动因素
该项目研究了抗生素耐药基因如何通过质粒偶联在肠道细菌之间转移。使用不同的培养环境和高通量筛选,博士生将确定影响转移速率的因素和影响偶联的物质。该项目旨在了解更广泛的微生物组如何影响基因转移,并验证小鼠模型中的发现,以帮助防止耐药性在人类和动物中传播。
6.异质电阻的机制和诊断
该项目研究细菌亚群如何通过基因变异和突变产生增加的抗生素耐药性。博士生将研究不同的病原体如何实现异质耐药性,研究不同细菌类型的常见耐药机制,并开发临床使用的诊断测试。该项目旨在了解细菌的适应并创建检测异质耐药性的实用工具。
7.相互作用细菌系统中对抗生素反应的机制模型
该项目研究了细菌群落如何相互作用和集体对抗生素做出反应。使用生长实验和分子分析,博士生将模拟环境变化如何影响微生物群落的生存和耐药性发展。该项目旨在通过了解复杂群落环境中的细菌行为来改进治疗策略,而不是孤立地研究物种。
8.抗肿瘤药物暴露对抗生素耐药性的附带敏感性影响
该研究项目研究了抗癌药物如何影响细菌进化和抗生素耐药性。博士生将研究细菌对抗肿瘤药物的遗传和表型反应,确定抗癌药物和抗生素之间的交叉耐药和敏感性模式。该项目旨在通过利用附带敏感性(对一种药物的耐药性使细菌更容易受到另一种药物的影响)来寻找减少感染癌症患者治疗失败的药物组合。
9.靶向 β-内酰胺酶耐药病原体的药物组合
该研究项目探索了可以逆转大肠杆菌和沙门氏菌等有害肠道细菌中 β-内酰胺类耐药性的药物组合。博士生将确定对耐药病原体有效的药物对,同时最大限度地减少对有益肠道细菌的影响。该项目旨在制定可持续的治疗策略,既能对抗当前的感染,又能减少抗生素耐药性,从而可能改变我们治疗高危临床感染的方式。
10.确定防止耐药性演变的药物组合
该研究项目开发工具和理论来评估抗生素组合如何影响细菌存活和耐药性进化。博士生将创建高通量方法来测试药物组合并预测细菌细胞变异如何影响耐药性的发展。通过测量细菌恢复时间和耐受性水平,他们将确定控制耐药性进化速度的因素。该项目旨在创建一个框架来预测药物组合下耐药性的发展,通过针对特定细老师株定制治疗方法来潜在地改善临床抗生素的使用。
03、其他项目信息
项目周期:2025年1月1日 – 2028年12月31日
申请截止日期:2025年12月31日
ENDAMR 博士项目属于欧盟资助的玛丽·居里博士网络(MSCA Doctoral Networks),其博士生待遇遵循玛丽·居里标准:
- 生活津贴:3,400 欧元左右
- 流动津贴:600 欧元
- 家庭津贴:660 欧元