导师简介
如果你想申请英国剑桥大学 生物医学系博士，那今天这期文章解析可能对你有用！今天Mason学长为大详细解析剑桥大学的Prof. Chung的研究领域和代表文章，同时，我们也推出了新的内容“科研想法&开题立意”，为同学们的科研规划提供一些参考，并且会对如何申请该导师提出实用的建议！方便大家进行套磁！后续我们也将陆续解析其他大学和专业的导师，欢迎大家关注！
作为剑桥大学病理学系的导师，她是当今分子生物学和病原体感染领域的杰出学者。导师现任剑桥大学病理学系医学研究委员会职业发展研究员及整合感染生物学助理教授，同时也是Corpus Christi College的研究员。
导师的学术生涯展现了丰富的国际化背景：本科和硕士学位就读于新西兰奥塔哥大学生物化学专业，博士学位获得于爱尔兰科克大学生物化学专业，专攻RNA病毒的非经典基因表达机制。随后在长期EMBO和Sir Henry Wellcome博士后奖学金的支持下，导师加入剑桥大学Plant Sciences系的Baulcombe实验室，深入研究miRNA介导的翻译调控机制。
研究领域
导师的研究兴趣涵盖多个前沿交叉领域：
核心研究方向：
- 翻译控制和蛋白质合成 (Translation control and protein synthesis)
- RNA结构与功能 (RNA structure and function)
- 宿主-病原体相互作用 (Host-pathogen interaction)
- 感染与免疫 (Infection and immunity)
- 外界胁迫响应 (External stresses including infection, temperature, pH)
- 生物技术应用 (Biotechnology)
导师的研究特色在于跨领域整合，从病毒、细菌到真核寄生虫，从植物到动物系统，全面解析生物体在复杂环境中的适应性基因表达机制。其长期科学愿景是理解生物体如何利用新颖的基因表达机制应对和适应复杂的生物系统挑战，并将这些分子发现转化为生物技术应用，以应对气候变化背景下的病原体感染问题。
研究分析
1. 《An RNA thermoswitch regulates daytime growth in Arabidopsis》
期刊： Nature Plants (2020)研究领域： RNA结构、温度响应、植物生物学主要内容： 该研究发现了第一个真核生物RNA温控开关，证明转录因子PIF7的mRNA在其5'UTR区域含有一个特殊的RNA发夹结构，该结构在温暖环境中(27-32°C)采用更松弛的构象，从而增强翻译效率，调控拟南芥的日间生长响应。研究首次在真核生物中发现了类似于原核生物的RNA温度计机制，为植物适应温度变化提供了全新的分子机制解释。
重要发现： 发现了真核生物中第一个RNA温控开关，阐明了植物快速响应温度变化的分子机制，为理解气候变化对植物生长的影响提供了关键见解。
2. 《The distinct translational landscapes of Gram-positive and Gram-negative bacteria》
期刊： Nature Communications (2023)研究领域： 细菌翻译、病原体生物学主要内容： 该研究利用核糖体谱测序技术(ribosome profiling)比较分析了革兰氏阳性(Listeria)和革兰氏阴性(Salmonella)细菌的翻译调控机制。发现了Listeria中一种新颖的"框外上游峰"(Out-of-frame Upstream Peak, OUP)介导的蛋白质合成起始机制，负责其40%的蛋白质产生。这一发现揭示了细菌翻译起始的复杂性，超出了之前的认知。
重要发现： 首次发现OUP介导的翻译起始机制，为理解不同细菌病原体的致病机制提供了新视角。
3. 《Endogenous miRNA in the green alga Chlamydomonas regulates gene expression through CDS-targeting》
期刊： Scientific Reports研究领域： 微RNA、翻译调控、进化生物学主要内容： 该研究全面分析了进化上遥远的单细胞绿藻Chlamydomonas中内源性miRNA对蛋白质合成的影响。发现与动物细胞类似，该藻类的miRNA主要通过mRNA去稳定化调控基因表达，但与动物不同的是，其靶点主要位于编码区而非3'UTR。
重要发现： 证明了miRNA功能的进化保守性，同时揭示了不同生物界在机制细节上的差异性。
4. 《RNA structure mediated thermoregulation: What can we learn from plants?》
期刊： Frontiers in Plant Science (2022)研究领域： RNA结构、温度调控、植物生物学主要内容： 该综述文章系统总结了植物中RNA结构介导的温度调控机制，比较了植物和原核生物RNA温度计的异同，并讨论了RNA ThermoSwitch的工作机制和应用前景。
重要发现： 提出了植物RNA ThermoSwitch的工作模型，为理解eukaryotic RNA温控机制提供了理论框架。
5. 《Monitoring Real-Time Temperature Dynamics of a Short RNA Hairpin Using Förster Resonance Energy Transfer and Circular Dichroism》
期刊： Methods in Molecular Biology (2023)研究领域： RNA结构、生物物理学、技术方法主要内容： 该方法学论文详细描述了使用FRET和圆二色谱技术实时监测RNA发夹结构温度动态变化的技术方法。为研究RNA温控机制提供了重要的技术工具。
重要发现： 建立了研究RNA温控开关实时动态的标准化方法。
6. 《Spatial proteomics identifies a novel CRTC-dependent viral sensing pathway that stimulates production of Interleukin-11》
期刊： Cell Reports (2024)研究领域： 病毒感染、免疫响应、蛋白质组学主要内容： 该研究利用空间蛋白质组学技术发现了一条新的CRTC依赖的病毒感知通路，该通路促进白细胞介素11的产生。研究为理解病毒感染的免疫响应机制提供了新见解。
重要发现： 识别了病毒感染中的新免疫响应通路，为抗病毒治疗提供了新靶点。
项目分析
1. riboSeqR - Bioinformatic software package for analysis of Ribosome Profiling data
研究领域： 生物信息学、翻译组学
项目内容： 与Dr Thomas Hardcastle合作开发，作为Bioconductor项目的一部分，该软件包专门用于帮助研究界分析核糖体谱测序数据。该工具解决了ribosome profiling这一高通量技术数据分析的技术难题，为全球研究人员提供了标准化的分析流程。
重要发现： 建立了ribosome profiling数据分析的标准化工具，大大降低了该技术的应用门槛。
2. Investigating translational control mechanisms at host-pathogen interface
研究领域： 宿主-病原体相互作用、翻译控制、感染生物学
项目内容： 该项目系统研究宿主细胞和细胞内病原体在感染过程中的翻译调控机制。通过ribosome profiling技术，全面解析感染期间宿主和病原体的基因表达变化，特别关注翻译水平的调控。项目涵盖病毒、细菌和真核寄生虫等多种病原体系统。
重要发现： 发现了哨兵细胞对渗透压变化的快速翻译诱导机制，识别了病原性细菌中的新颖翻译机制。
3. Engineering biological systems for biotechnological applications to combat pathogen infection in the face of climate change
研究领域： 合成生物学、气候适应、生物技术
项目内容： 该前瞻性项目旨在利用对新颖基因表达机制的发现，设计和工程化生物系统以应对气候变化背景下的病原体感染挑战。项目整合了RNA温控机制、翻译调控和宿主-病原体相互作用的研究成果，开发具有气候适应性的生物防御系统。
重要发现： 开发了基于RNA ThermoSwitch的蛋白质表达控制系统，为合成生物学应用提供了新工具。
研究想法
1. RNA温控开关在作物育种中的应用
- 研究思路： 利用导师发现的RNA温控开关机制，开发具有温度适应性的作物品种。通过基因工程技术，将特定的RNA温控开关引入重要农作物中，使其能够在气候变化背景下更好地适应温度波动。
- 创新点： 首次将RNA温控机制应用于作物改良，为气候适应性农业提供新技术。
- 可行性： 基于已有的RNA温控开关机制研究，技术路径清晰可行。
- 应用前景： 对全球粮食安全具有重要意义。
2. 细菌OUP机制在抗菌药物开发中的应用
- 研究思路： 基于导师发现的革兰氏阳性细菌OUP翻译起始机制，开发新型抗菌药物。通过设计特异性抑制OUP机制的小分子化合物，实现对特定病原菌的精准打击。
- 创新点： 首次针对细菌特异性翻译机制设计抗菌药物，避免传统抗生素的广谱杀伤。
- 可行性： 已明确了OUP机制的分子细节，为药物设计提供了明确靶点。
- 应用前景： 为应对抗生素耐药性危机提供新策略。
3. miRNA CDS靶向机制在基因治疗中的应用
- 研究思路： 利用导师在Chlamydomonas中发现的miRNA CDS靶向机制，开发新型基因治疗载体。设计能够特异性靶向疾病相关基因编码区的人工miRNA，实现精准的基因表达调控。
- 创新点： 突破传统miRNA只能靶向3'UTR的限制，扩大基因治疗的靶点范围。
- 可行性： 基础机制研究已经完成，技术转化路径相对清晰。
- 应用前景： 为遗传性疾病治疗提供新思路。
4. 宿主-病原体翻译调控网络在疫苗设计中的应用
- 研究思路： 基于导师对宿主-病原体翻译调控机制的深入研究，设计新型疫苗策略。通过调控特定的翻译控制节点，增强免疫反应或减少病原体感染。
- 创新点： 从翻译调控角度设计疫苗，为疫苗开发提供新策略。
- 可行性： 已有宿主-病原体相互作用的详细机制研究基础。
- 应用前景： 为传染病防控提供更有效的疫苗技术。
申请建议
1. 学术背景准备
必备基础知识：
- 分子生物学、细胞生物学基础扎实
- RNA生物学相关知识，特别是RNA结构与功能
- 微生物学或植物生物学背景
- 生化技术和分子实验技能
- 基础的生物信息学分析能力
2. 研究经验积累
实验技能准备：
- 熟练掌握常规分子生物学技术（PCR、克隆、转化等）
- 具备RNA相关实验经验（RT-PCR、Northern blot、FISH等）
- 掌握细胞培养和微生物培养技术
- 有蛋白质表达和纯化经验者优先
- 具备基础的显微镜操作和成像技术
研究项目经验：
- 参与过RNA功能或结构相关研究项目
- 有宿主-病原体相互作用研究经验
- 参与过翻译调控机制研究
- 具备跨学科研究经验（如生物物理学、合成生物学）
3. 技能发展重点
生物信息学能力：
- 学习R语言，熟悉riboSeqR等软件使用
- 掌握基础的生物信息学分析流程
- 了解高通量测序数据分析方法
- 具备基础的统计学知识
期刊文献阅读：
- 深入研读导师的主要论文，特别是Nature Plants(2020)和Nature Communications(2023)的文章
- 关注RNA Biology、Nature Communications、Cell等期刊的最新进展
- 了解ribosome profiling、RNA温控开关等领域的前沿动态
4. 申请材料准备
研究计划书撰写：
- 明确提出基于导师研究方向的创新性问题
- 展示对RNA温控机制或宿主-病原体翻译调控的深入理解
- 提出具体可行的实验设计和技术路线
- 体现跨学科整合思维和创新性思路
推荐信策略：
- 寻找有相关研究背景的推荐人
- 重点突出你在RNA生物学或微生物研究方面的能力
- 强调独立研究能力和跨学科学习适应性
博士背景
Darwin，985生物医学工程系博士生，专注于合成生物学和再生医学的交叉研究。擅长运用基因编辑技术和组织工程方法，探索人工器官构建和个性化医疗的新途径。在研究CRISPR-Cas9系统在干细胞定向分化中的应用方面取得重要突破。曾获国家自然科学基金优秀青年科学基金项目资助，研究成果发表于《Nature Biotechnology》和《Biomaterials》等顶级期刊。
【竞赛报名/项目咨询+微信：mollywei007】
